Genotypisierung

Nach 2018 haben wir in 2020 eine zweite genetische Untersuchung durchgeführt. Hier wurden nochmals 50 Tiere untersucht. Die Ergebnisse wurden von Dr. Lisa Jung von der Uni Witzenhausen anlässlich unseres Züchtertreffens im Oktober 2021 vorgestellt.

Hier eine PowerPointPräsentation
ppp-verwandtschaftwollschweine.pdf [514 KB]

Hier die Auswertungen der Genotypisierung 2020
distancematrix_rassen_eber_sau.pdf [36 KB]
distancematrix_rassen_eber_sau.xlsx [12 KB]

interaktiveheatmapwollschwein.html [4.238 KB]
interaktivepcageschlechtzuechterwollschwein.html [3.589 KB]

Erläuterungen zu den Auswertungen [60 KB]

Ihr erhaltet nun endlich die aufbereiteten Ergebnisse aus den Genotypisierungen Eurer Wollschweine. Lisa Jung hat uns folgende Darstellungen zusammengestellt:

Interaktive PCA Geschlecht Zuechter Wollschwein 2021: Auf dieser Grafik sind nun die einzelnen Eber und Sauen erkennbar. Wenn Ihr mit der Maus auf den jeweiligen Punkt geht, findet Ihr Tiername, Züchter, Rasse und Geschlecht. Mit dieser Darstellung kann man schon erkennen, welches Tier eine entferntere oder nähere genetische Distanz (Verwandtschaft) zu einem anderen möglichen Paarungspartner hat und jede/r von Euch kann die ausgewerteten Tiere zueinander abschätzen. Einschließlich derer, die als andere Rasse definiert waren und deren Einordnung/Abstammung zu überprüfen ist.
interaktivepcageschlechtzuechterwollschwein.html [3.589 KB]

Interaktive Heatmap Wollschwein2021: Dieses blaue Werk mit roter Diagonale sieht erst einmal ziemlich wild aus… ist aber eine wirklich spannende Grafik. Hier sind alle analysierten Eber und alle Sauen in eine Matrix zusammengeführt, um zu sehen, wie sich ihre Verwandtschaft miteinander auswirkt, falls man sie miteinander anpaaren würde, sie zeigt also wie nah sie sich genetisch sind (auch diejenigen innerhalb des selben Geschlechts). Hier könnt Ihr wieder jeweils mit der Maus auf die kleinen Felder gehen, dann erscheinen alle Ergebnisse der Distanzen der einzelnen „Pärchen“.

Zunächst einmal zur Einordnung der Werten: Rot, d.h. die Diagonale mit dem Wert 1 ist, wenn man ein Tier jeweils mit sich selbst und gleichgeschlechtlich anpaaren (sozusagen klonen) würde/könnte. Der Wert 1 bedeutet eine vollständig übereinstimmende Verwandtschaft des Nachkommens. Darum die Diagonale: in der Matrix kommt jedes Tier einmal mit sich selbst zusammen.

Wenn man die Werte-Leiste rechts ansieht, erkennt man unterschiedliche Farbtöne. Das geht von hellrot (z.B. Anpaarung von Naomi Günther mit Freddy Zoo Erfurt) mit dem höchsten Wert (hohe Inzucht) einher und schließt auf sehr enge Verwandtschaft der beiden verglichenen Tiere wie z.B. Geschwister, direkte Nachkommen etc. Rot sind z.B. die Eber blau/Eber schwarz von Christine Kemner oder Cilli und Wol358 von Johanna Mehringer. Da wisst Ihr sicher selbst, wie sie verwandtschaftlich zueinander stehen.

Je dunkler blau und je geringer die Zahl sind dann logischerweise die Anpaarungen von am wenigsten verwandten Tieren, die dann Nachkommen mit geringen Inzuchtwerten produzieren. Natürlich müsst Ihr immer drauf achten, dass beide getesteten Tiere auch ein Eber und eine Sau sind - sonst klappt es natürlich nicht mit Nachkommen… (s. dann die folgende Datei)

Zu beachten ist, dass in der Matrix alle „Paarungen“ jeweils 2 mal vorhanden sind, also ober- und unterhalb der Diagonale, also jedes Tier wird einmal als Tier 1 und einmal als Tier 2 aufgeführt in der gleichen Paarung. Wenn Ihr durchschaut genügt es also, wenn Ihr Euch entweder für das obere oder untere Dreieck entscheidet, weil sich gegenüber alles wiederholt.
interaktiveheatmapwollschwein.html [4.238 KB]

DistanceMatrix_Rassen_Eber_Sau2021: Wenn Ihr Euch dann voll in die roten und blauen Schattierungen versenkt hattet und euch die Zahlen zwischen 0,69 und 1 dann etwas sagen, könnt Ihr euch diese Datei ansehen. Hier sind nun alle analysierten Eber und Sauen virtuell miteinander verpaart und die Züchter*innen jeweils übersichtlich in einer Tabelle dargestellt. Lisa hat hier die Nachkommen mit sehr hoher Inzucht orange gekennzeichnet, hier wäre eine Anpaarung nicht empfehlenswert. Also Elsa Warder mit David Mehringer wäre keine gute Paarung. Jedenfalls seid Ihr mit dieser Grafik schon einmal in der Lage, zu entscheiden und selbst Kontakt aufzunehmen z.B. bei der Suche nach einem neuen Eber.
distancematrix_rassen_eber_sau.xlsx [12 KB]

Natürlich ist die Genetik nicht alles: auch das Exterieur, also ein schönes und korrektes Zuchttier ist die andere Hälfte, die eure Entscheidung mit beeinflussen sollte. Mehrere aussagekräftige Fotos helfen dann auch schon einmal für den ersten Eindruck, bevor man die meist weite Strecke auf sich nimmt.

Rudi und ich möchten Lisa an dieser Stelle ganz herzlich für ihre Arbeit, die sehr praxistauglichen Grafiken und ihre Bereitschaft danken, uns auch weiterhin zu unterstützen beim Aufbau unseres Wolli-Zuchtbuchs. Wenn dann die Genotypisierungen von 2019 und 2021 zusammengefügt sind, werden wir endlich unseren Plan verwirklichen können, Zuchtlinien zu bilden, damit für euch alle die Suche nach passenden Paarungspartnern erleichtert wird. Euer Beitrag ist dabei nur, immer schön alle Tiere und Nachzucht an Rudi zu melden, damit die Daten immer frisch sind und Rudi euch beraten und unterstützen kann.

Die allerbesten Grüße und auf ein baldiges Wiedersehen

Karola und Rudi